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Margarita Rojas González es profesora e investigadora de la Universidad Nacional. Entre 2006 y 2010 fue directora del Sistema Nacional de Bibliotecas, del Ministerio de Cultura y Juventud.
Actualmente es la coordinadora del proyecto Biblioteca electrónica Scriptorium, de la Facultad de Filosofía y Letras de la Universidad Nacional. Ha sido profesora invitada en la Universidad de Pennsylvania y en el postgrado en literatura de la Universidad de Villanova, ambas de Pennsylvania, Estados Unidos, y en la Universidad Francois Rabelais, de la ciudad de Tours, Francia.
Con Flora Ovares ha realizado varias investigaciones sobre la literatura costarricense. Producto de esto han publicado los libros: La casa paterna. Escritura y nación en Costa Rica, que obtuvo el Premio Nacional de Ensayo en 1993, En el tinglado de la eterna comedia, dos tomos sobre el teatro; Cien años de literatura costarricense, ganador del Premio Áncora de 1995.
Obtuvo el Premio de Ensayo Editorial Costa Rica en 1995 con El último baluarte del imperio. Latinoamérica y España en la crítica antimodernista. Es autora de alrededor de 42 artículos, del libro La ciudad y la noche. La nueva narrativa latinoamericana, y de la compilación Escrito de Luisa González.